En semifinales eliminó al Puebla, que si bien rescató un empate como local a uno, en la vuelta Cruz Azul ganó a los de la Franja con severa goleada de 6 a 1. En la final enfrenta al novel equipo Atlético Español, equipacion atletico de madrid 2023 quien logra derrotar a los azules en el juego de ida. En 1962 logra el ascenso a la primera división y si bien en 1963 y 1964, se ubica en la tercera posición del Campeonato Uruguayo, la difícil situación económica de la que no termina de salir el club lo lleva a perder la categoría en 1966, pese incluso a haber finalizado el primer semestre en la primera posición del campeonato, en una situación muy similar a la 1961. A partir de entonces, agobiado por las deudas, el club comienza un curioso proceso de reclutamiento de jugadores en la liga amateur Guruyú.
