Dos años después, en 2010, se retomó el escudo de la cara del águila mirando hacia la derecha. No obstante, durante la década de 1990 se empezó a popularizar otro escudo en las camisetas del club, el cual era la cara de un águila mirando hacia la izquierda y con la leyenda «Motagua» en la parte inferior. Finalmente, en 2016, la directiva presentó ante medios de comunicación su nuevo escudo, el cual está basado en el diseño habitual pero con la leyenda de «Motagua» en la parte superior y de «Honduras» en la parte inferior.
